Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-8■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 PDE3A-202ENST00000542675 685 ntTSL 314.6□□□□□ -0.072e-8■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.111e-323■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.465e-7■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.145e-7■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.15e-7■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 520.87■□□□□ 0.935e-7■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 RPL13A-205ENST00000474171 521 ntTSL 213.76□□□□□ -0.211e-323■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 RPL13A-207ENST00000476300 619 ntTSL 312.15□□□□□ -0.461e-323■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 RPL13A-203ENST00000468655 407 ntTSL 210.94□□□□□ -0.661e-323■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 TAF1D-206ENST00000527068 1023 ntTSL 53.87□□□□□ -1.791e-323■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 TAF1D-207ENST00000527169 1127 ntTSL 521.28■■□□□ 12e-80■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 TAF1D-214ENST00000530089 1429 ntTSL 33.5□□□□□ -1.852e-80■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 219.8■□□□□ 0.762e-32■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 SNHG21-202ENST00000558174 725 ntTSL 217.2■□□□□ 0.347e-11■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.347e-11■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.057e-11■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.08□□□□□ -1.447e-11■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.06□□□□□ -2.47e-11■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.052e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 USP14-202ENST00000383589 2168 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 USP14-205ENST00000578942 3189 ntTSL 212.41□□□□□ -0.422e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 USP14-204ENST00000578786 1104 ntTSL 53.33□□□□□ -1.882e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 SLC2A4RG-203ENST00000474248 624 ntTSL 227.89■■■□□ 2.061e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 SLC2A4RG-205ENST00000485897 518 ntTSL 527.44■■□□□ 1.981e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-214ENST00000503282 584 ntTSL 226.71■■□□□ 1.876e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.756e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-229ENST00000510129 582 ntTSL 325.93■■□□□ 1.746e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-216ENST00000503742 1977 ntTSL 1 (best)24.98■■□□□ 1.596e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-220ENST00000505307 743 ntTSL 524.42■■□□□ 1.56e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-215ENST00000503418 662 ntTSL 423.8■■□□□ 1.46e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 PPP6R2-206ENST00000427222 1811 ntTSL 521.32■■□□□ 11e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-213ENST00000502690 599 ntTSL 420.94■□□□□ 0.946e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-228ENST00000508974 568 ntTSL 418.12■□□□□ 0.496e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.426e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.221e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.131e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 PPP6R2-205ENST00000401672 2199 ntTSL 215.69■□□□□ 0.11e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.076e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.171e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-7■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-232ENST00000514755 593 ntTSL 413.43□□□□□ -0.266e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-209ENST00000394804 4166 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.316e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-206ENST00000357194 660 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.46e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-227ENST00000508818 584 ntTSL 212.33□□□□□ -0.446e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-208ENST00000394803 2227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.586e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.66e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-223ENST00000508249 604 ntTSL 411.17□□□□□ -0.626e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-222ENST00000508238 547 ntTSL 49.69□□□□□ -0.866e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.086e-12■■□□□ 12.2
AATFQ9NY61 WDR43-206ENST00000466067 628 ntTSL 26.97□□□□□ -1.296e-12■■□□□ 12.1
AATFQ9NY61 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.96□□□□□ -1.948e-12■■□□□ 12.1
AATFQ9NY61 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.318e-22■■□□□ 12
AATFQ9NY61 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 221.53■■□□□ 1.048e-22■■□□□ 12
AATFQ9NY61 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.928e-22■■□□□ 12
AATFQ9NY61 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 520.21■□□□□ 0.838e-22■■□□□ 12
AATFQ9NY61 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 219.56■□□□□ 0.728e-22■■□□□ 12
AATFQ9NY61 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 324.96■■□□□ 1.591e-21■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.469e-74■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.751e-7■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21e-7■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 PPP2CB-207ENST00000520500 603 ntTSL 47.5□□□□□ -1.211e-7■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 PPP2CB-202ENST00000518243 577 ntTSL 35.22□□□□□ -1.571e-7■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC7.29□□□□□ -1.241e-68■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.416e-7■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 PPP2R5C-227ENST00000557268 2013 ntTSL 216.77■□□□□ 0.286e-7■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.416e-7■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.696e-7■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.946e-7■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 PPP2R5C-215ENST00000556068 3363 ntTSL 27.76□□□□□ -1.176e-7■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 225.03■■□□□ 1.63e-6■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 210.7□□□□□ -0.73e-6■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.392e-17■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.12e-17■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.742e-17■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.092e-17■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)10.44□□□□□ -0.742e-17■■□□□ 11.9
AATFQ9NY61 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 519.08■□□□□ 0.652e-7■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 518.78■□□□□ 0.62e-7■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.52e-7■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 517.94■□□□□ 0.462e-7■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 317.62■□□□□ 0.412e-7■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 517.6■□□□□ 0.412e-7■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.352e-7■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.232e-7■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 511.3□□□□□ -0.62e-7■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 GLUL-209ENST00000480604 908 ntTSL 59.54□□□□□ -0.884e-7■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.321e-6■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.434e-9■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.084e-9■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 RBM14-206ENST00000460762 459 ntTSL 224.74■■□□□ 1.552e-7■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 RBM14-209ENST00000512283 567 ntTSL 422.46■■□□□ 1.192e-7■■□□□ 11.8
AATFQ9NY61 WAC-212ENST00000448193 506 ntTSL 232.7■■■□□ 2.835e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.565e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 TGFBR1-207ENST00000549766 1678 ntTSL 529■■■□□ 2.235e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 ADAT3-202ENST00000454697 983 ntTSL 324.2■■□□□ 1.465e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.445e-6■■□□□ 11.7
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