RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577887.1

SNORD53B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53B, humanhuman

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Gene SNORD53B, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53B-201ENST00000577887 NISCHQ9Y2I1 1504 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD53B-201ENST00000577887 ABCC9O60706 1549 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53B-201ENST00000577887 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD53B-201ENST00000577887 DCAF8L2P0C7V8 631 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD53B-201ENST00000577887 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa3.17□□□□□ -1.9
SNORD53B-201ENST00000577887 NACADO15069 1562 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD53B-201ENST00000577887 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
SNORD53B-201ENST00000577887 MYO15BQ96JP2 1530 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53B-201ENST00000577887 DNAJC5BQ9UF47 199 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53B-201ENST00000577887 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD53B-201ENST00000577887 CECR2Q9BXF3 1484 aa3.02□□□□□ -1.93
SNORD53B-201ENST00000577887 SCRIBQ14160 1630 aa3.01□□□□□ -1.93
SNORD53B-201ENST00000577887 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa3□□□□□ -1.93
SNORD53B-201ENST00000577887 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD53B-201ENST00000577887 UNC13AQ9UPW8 1703 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD53B-201ENST00000577887 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD53B-201ENST00000577887 BICRAQ9NZM4 1560 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD53B-201ENST00000577887 ERCC6Q03468 1493 aa2.96□□□□□ -1.93
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SNORD53B-201ENST00000577887 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa2.91□□□□□ -1.94
SNORD53B-201ENST00000577887 CUX2O14529 1486 aa2.9□□□□□ -1.94
SNORD53B-201ENST00000577887 SMARCA2P51531 1590 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD53B-201ENST00000577887 PDS5BQ9NTI5 1447 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD53B-201ENST00000577887 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD53B-201ENST00000577887 NCAPD3P42695 1498 aa2.87□□□□□ -1.95
SNORD53B-201ENST00000577887 TRIM41Q8WV44 630 aa2.86□□□□□ -1.95
SNORD53B-201ENST00000577887 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
SNORD53B-201ENST00000577887 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53B-201ENST00000577887 HMGXB3Q12766 1538 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53B-201ENST00000577887 SMARCA4P51532 1647 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53B-201ENST00000577887 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53B-201ENST00000577887 OSCARQ8IYS5 282 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD53B-201ENST00000577887 CADPSQ9ULU8 1353 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD53B-201ENST00000577887 CEP164Q9UPV0 1460 aa2.81□□□□□ -1.96
SNORD53B-201ENST00000577887 NESP48681 1621 aa2.81□□□□□ -1.96
SNORD53B-201ENST00000577887 MRC2Q9UBG0 1479 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53B-201ENST00000577887 TRHP20396 242 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD53B-201ENST00000577887 FBLN2P98095 1184 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD53B-201ENST00000577887 PEG3Q9GZU2 1588 aa2.78□□□□□ -1.96
SNORD53B-201ENST00000577887 FANCD2Q9BXW9 1451 aa2.78□□□□□ -1.96
SNORD53B-201ENST00000577887 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
SNORD53B-201ENST00000577887 MROH2BQ7Z745 1585 aa2.78□□□□□ -1.96
SNORD53B-201ENST00000577887 ABCC8Q09428 1581 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD53B-201ENST00000577887 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD53B-201ENST00000577887 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD53B-201ENST00000577887 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD53B-201ENST00000577887 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD53B-201ENST00000577887 WDR62O43379 1518 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD53B-201ENST00000577887 CYB5RLQ6IPT4 315 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD53B-201ENST00000577887 CFTRP13569 1480 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD53B-201ENST00000577887 IFT140Q96RY7 1462 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD53B-201ENST00000577887 WIZO95785 1651 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD53B-201ENST00000577887 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD53B-201ENST00000577887 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
SNORD53B-201ENST00000577887 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
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SNORD53B-201ENST00000577887 SOGA1O94964 1423 aa2.71□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 CCDC88BA6NC98 1476 aa2.71□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 DNMBPQ6XZF7 1577 aa2.7□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 TOPBP1Q92547 1522 aa2.7□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 PRDM2Q13029 1718 aa2.7□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 SYNJ1O43426 1573 aa2.7□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 ARHGEF11O15085 1522 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 GRIN2BQ13224 1484 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP2.68□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa2.68□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa2.68□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa2.68□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 WDR97A6NE52 1622 aa2.68□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 SYNJ2O15056 1496 aa2.67□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 GAPVD1Q14C86 1478 aa2.67□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa2.67□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 FGD5Q6ZNL6 1462 aa2.66□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa2.66□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 CHD1O14646 1710 aa2.65□□□□□ -1.98
SNORD53B-201ENST00000577887 FAM69CQ0P6D2 419 aa2.65□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 ARAP1Q96P48 1450 aa2.65□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 JPH4Q96JJ6 628 aa2.64□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 FHAD1B1AJZ9 1412 aa2.64□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa2.64□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 CUX1P39880 1505 aa2.63□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa2.63□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 KIF27Q86VH2 1401 aa2.62□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 GRIN2AQ12879 1464 aa2.62□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 PBRM1Q86U86 1689 aa2.62□□□□□ -1.99
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SNORD53B-201ENST00000577887 PTPRGP23470 1445 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD53B-201ENST00000577887 CLASP1Q7Z460 1538 aa2.6□□□□□ -1.99
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