Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.195e-8■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.921e-12■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.391e-12■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.59e-7■■■■■ 37.8
PUM2Q8TB72 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.148e-7■■■■■ 37.8
PUM2Q8TB72 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.762e-8■■■■■ 37.8
PUM2Q8TB72 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 37.8
PUM2Q8TB72 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 37.8
PUM2Q8TB72 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.198e-8■■■■■ 37.8
PUM2Q8TB72 TAF1-219ENST00000492404 1249 ntTSL 56.43□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 37.8
PUM2Q8TB72 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 37.8
PUM2Q8TB72 RAB6B-207ENST00000543906 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 37.8
PUM2Q8TB72 ZNF830-202ENST00000578339 667 ntTSL 310.04□□□□□ -0.82e-18■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 ZNF830-201ENST00000361952 2246 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.92e-18■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.416e-9■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)27.49■■□□□ 1.992e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.572e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.462e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.442e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)23.05■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.262e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.173e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.912e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 220.46■□□□□ 0.872e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.652e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 SNX13-206ENST00000474067 603 ntTSL 318.76■□□□□ 0.593e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 HDAC5-205ENST00000587135 504 ntTSL 218.04■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.482e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 PAIP1-205ENST00000504639 1766 ntTSL 517.74■□□□□ 0.432e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.423e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.392e-13■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.312e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 HDAC5-209ENST00000588703 445 ntTSL 316.53■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 HDAC5-210ENST00000591714 667 ntTSL 315.26■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 01e-6■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 SNX13-204ENST00000444712 2018 ntTSL 515.05■□□□□ -03e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 SENP2-202ENST00000413407 2383 ntTSL 214.84□□□□□ -0.031e-16■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 SNX13-205ENST00000471744 454 ntTSL 414.1□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 SNX13-207ENST00000475800 507 ntTSL 414.1□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 512.98□□□□□ -0.332e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 ASF1A-202ENST00000511766 573 ntTSL 212.78□□□□□ -0.361e-16■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.482e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 HMGCR-208ENST00000509431 421 ntTSL 211.9□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.542e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-216ENST00000512683 475 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 ABI1-204ENST00000376138 3503 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.622e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 RAB2A-205ENST00000466595 866 ntTSL 311.14□□□□□ -0.632e-13■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 MTMR3-203ENST00000351488 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.653e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 RAB2A-202ENST00000396696 614 ntTSL 210.87□□□□□ -0.672e-13■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 SNX13-202ENST00000409604 4146 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 KNL1-212ENST00000534204 565 ntTSL 410.4□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 PTPN2-203ENST00000353319 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 MTMR3-210ENST00000491251 569 ntTSL 210.03□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 ABI1-201ENST00000346832 3289 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.872e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 PTPN2-210ENST00000591115 1648 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 EPG5-209ENST00000590884 3767 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 RAB2A-209ENST00000530071 659 ntTSL 58.89□□□□□ -0.992e-13■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 ABI1-205ENST00000376139 3516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.012e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 ABI1-208ENST00000376160 3515 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.032e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 XPNPEP3-203ENST00000428799 2737 ntTSL 28.52□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 ABI1-209ENST00000376166 3441 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.052e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 ERI1-202ENST00000518663 698 ntTSL 58.19□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 SNX13-208ENST00000482558 1139 ntTSL 27.81□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 EPG5-205ENST00000587884 4232 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.282e-10■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 EPG5-202ENST00000585906 4348 ntTSL 26.95□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 EPG5-210ENST00000592272 3999 ntTSL 1 (best)6.79□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 37.7
PUM2Q8TB72 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 37.7
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 139.9 ms