Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 UBN1-203ENST00000585857 545 ntTSL 417.2■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 TRAP1-203ENST00000570403 521 ntTSL 428.6■■■□□ 2.171e-6■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 STRN3-207ENST00000555358 2208 ntTSL 1 (best)26.96■■□□□ 1.915e-12■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 226.95■■□□□ 1.95e-12■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 PPA2-208ENST00000502596 714 ntTSL 521.54■■□□□ 1.044e-6■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.995e-12■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 RNF40-207ENST00000565931 481 ntTSL 420.02■□□□□ 0.82e-6■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 AFDN-218ENST00000507704 1031 ntTSL 317.13■□□□□ 0.335e-12■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.335e-12■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 RNF40-208ENST00000565995 586 ntTSL 416.94■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.034e-6■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 PPP4R1-219ENST00000581250 578 ntTSL 414.92□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 PPP4R1-220ENST00000581835 379 ntTSL 212.84□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 210.13□□□□□ -0.795e-12■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 PPP4R1-216ENST00000580283 378 ntTSL 29.21□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 PRKAR2A-203ENST00000419216 581 ntTSL 426.61■■□□□ 1.854e-9■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.134e-9■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.654e-9■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.144e-9■■■■□ 23.2
FMR1Q06787 MCM4-214ENST00000523853 354 ntTSL 210.32□□□□□ -0.761e-7■■■■□ 23.1
FMR1Q06787 CHD4-213ENST00000545584 553 ntTSL 425.29■■□□□ 1.644e-14■■■■□ 23.1
FMR1Q06787 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 23.1
FMR1Q06787 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 23.1
FMR1Q06787 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 23.1
FMR1Q06787 ARVCF-209ENST00000487793 863 ntTSL 222.49■■□□□ 1.191e-7■■■■□ 23.1
FMR1Q06787 PRPF40A-210ENST00000489741 776 ntTSL 38.28□□□□□ -1.085e-7■■■■□ 23.1
FMR1Q06787 DDX17-207ENST00000475004 443 ntTSL 312.34□□□□□ -0.435e-6■■■■□ 23.1
FMR1Q06787 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 23.1
FMR1Q06787 DDX24-210ENST00000622786 1730 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 23.1
FMR1Q06787 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.772e-6■■■■□ 23
FMR1Q06787 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.562e-6■■■■□ 23
FMR1Q06787 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.562e-6■■■■□ 23
FMR1Q06787 KDM5B-201ENST00000235790 4418 ntTSL 215.73■□□□□ 0.118e-7■■■■□ 23
FMR1Q06787 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 521.73■■□□□ 1.073e-7■■■■□ 23
FMR1Q06787 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.763e-7■■■■□ 23
FMR1Q06787 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 58.07□□□□□ -1.123e-7■■■■□ 23
FMR1Q06787 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.843e-7■■■■□ 23
FMR1Q06787 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.257e-8■■■■□ 23
FMR1Q06787 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.057e-8■■■■□ 23
FMR1Q06787 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.747e-8■■■■□ 23
FMR1Q06787 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.657e-8■■■■□ 23
FMR1Q06787 MRFAP1-204ENST00000512914 1982 nt18.48■□□□□ 0.557e-8■■■■□ 23
FMR1Q06787 HK1-212ENST00000480047 575 ntTSL 1 (best)12.7□□□□□ -0.381e-12■■■■□ 23
FMR1Q06787 HK1-213ENST00000483054 592 ntTSL 39.38□□□□□ -0.911e-12■■■■□ 23
FMR1Q06787 HK1-204ENST00000421088 707 ntTSL 58.88□□□□□ -0.991e-12■■■■□ 23
FMR1Q06787 HK1-208ENST00000464803 450 ntTSL 1 (best)6.93□□□□□ -1.31e-12■■■■□ 23
FMR1Q06787 HK1-210ENST00000476368 605 ntTSL 36.76□□□□□ -1.331e-12■■■■□ 23
FMR1Q06787 HK1-214ENST00000483077 750 ntTSL 36.51□□□□□ -1.371e-12■■■■□ 23
FMR1Q06787 HK1-207ENST00000450646 739 ntTSL 56.15□□□□□ -1.421e-12■■■■□ 23
FMR1Q06787 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 58.92□□□□□ -0.982e-7■■■■□ 23
FMR1Q06787 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.613e-6■■■■□ 23
FMR1Q06787 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.533e-6■■■■□ 23
FMR1Q06787 MYH9-205ENST00000463027 562 ntTSL 315.91■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 23
FMR1Q06787 NSD1-216ENST00000638627 1866 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.844e-7■■■■□ 23
FMR1Q06787 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.384e-7■■■■□ 23
FMR1Q06787 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.484e-7■■■■□ 23
FMR1Q06787 DYNC1H1-207ENST00000555800 474 ntTSL 211.86□□□□□ -0.512e-9■■■■□ 23
FMR1Q06787 CAPRIN1-203ENST00000526477 587 ntTSL 228.94■■■□□ 2.222e-10■■■■□ 23
FMR1Q06787 CAPRIN1-205ENST00000528856 595 ntTSL 528.94■■■□□ 2.222e-10■■■■□ 23
FMR1Q06787 CAPRIN1-216ENST00000534042 574 ntTSL 521.95■■□□□ 1.12e-10■■■■□ 23
FMR1Q06787 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.212e-10■■■■□ 23
FMR1Q06787 CAPRIN1-201ENST00000341394 4108 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.572e-10■■■■□ 23
FMR1Q06787 POLR2A-209ENST00000617998 6751 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 EIF4G1-229ENST00000457456 983 ntTSL 210.74□□□□□ -0.699e-8■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 AHNAK-207ENST00000531324 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.95■■□□□ 1.262e-8■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 LTBP4-232ENST00000610893 578 ntTSL 425.37■■□□□ 1.651e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 LTBP4-234ENST00000612845 527 ntTSL 418.73■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 LTBP4-228ENST00000600499 580 ntTSL 217.72■□□□□ 0.431e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 CDC42BPA-208ENST00000442054 3786 ntTSL 1 (best)8.67□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 CDC42BPA-209ENST00000448940 7355 ntTSL 1 (best)6.18□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.363e-8■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.33e-8■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 UBN1-206ENST00000587027 837 ntTSL 316.57■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.473e-8■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 AFDN-221ENST00000511637 5999 ntTSL 1 (best)10.12□□□□□ -0.793e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.275e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.985e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.775e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.645e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.575e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.495e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 CAPNS1-214ENST00000592483 431 ntTSL 530.58■■■□□ 2.495e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.395e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.365e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 ACTN1-220ENST00000556433 1259 ntTSL 329.06■■■□□ 2.245e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.185e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.145e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 TAL1-203ENST00000459729 1796 ntTSL 1 (best)27.69■■■□□ 2.025e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 AVL9-207ENST00000485228 489 ntTSL 526.08■■□□□ 1.775e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.715e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.695e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.685e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.645e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.525e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.55e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 PIEZO1-206ENST00000474606 544 ntTSL 423.18■■□□□ 1.35e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 PLEKHJ1-212ENST00000589791 1329 ntTSL 222.91■■□□□ 1.265e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.255e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 PIEZO1-215ENST00000566414 564 ntTSL 422.61■■□□□ 1.215e-6■■■■□ 22.9
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 59.1 ms