Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM3P25205 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM3P25205 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM3P25205 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM3P25205 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM3P25205 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM3P25205 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM3P25205 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM3P25205 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM3P25205 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM3P25205 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM3P25205 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM3P25205 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM3P25205 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM3P25205 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM3P25205 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM3P25205 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM3P25205 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCM3P25205 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM3P25205 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCM3P25205 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms