Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHGAP10645 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHGAP10645 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CHGAP10645 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHGAP10645 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHGAP10645 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHGAP10645 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHGAP10645 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHGAP10645 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHGAP10645 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CHGAP10645 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CHGAP10645 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHGAP10645 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CHGAP10645 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHGAP10645 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHGAP10645 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHGAP10645 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHGAP10645 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHGAP10645 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHGAP10645 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHGAP10645 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHGAP10645 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHGAP10645 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHGAP10645 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHGAP10645 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CHGAP10645 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHGAP10645 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHGAP10645 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHGAP10645 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHGAP10645 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHGAP10645 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHGAP10645 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHGAP10645 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHGAP10645 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHGAP10645 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHGAP10645 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHGAP10645 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHGAP10645 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHGAP10645 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHGAP10645 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CHGAP10645 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHGAP10645 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHGAP10645 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHGAP10645 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CHGAP10645 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHGAP10645 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CHGAP10645 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHGAP10645 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHGAP10645 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHGAP10645 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHGAP10645 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHGAP10645 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHGAP10645 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CHGAP10645 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHGAP10645 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CHGAP10645 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CHGAP10645 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CHGAP10645 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHGAP10645 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHGAP10645 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHGAP10645 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHGAP10645 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CHGAP10645 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHGAP10645 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHGAP10645 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHGAP10645 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHGAP10645 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHGAP10645 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHGAP10645 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHGAP10645 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHGAP10645 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHGAP10645 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHGAP10645 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHGAP10645 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHGAP10645 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHGAP10645 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHGAP10645 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHGAP10645 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHGAP10645 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms