Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DEV8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
B4DEV8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DEV8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DEV8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DEV8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DEV8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DEV8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DEV8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DEV8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DEV8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DEV8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DEV8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DEV8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DEV8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DEV8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DEV8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms