Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N1

COX11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11Q9Y6N1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX11Q9Y6N1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX11Q9Y6N1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms