Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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C1orf61Q13536 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
C1orf61Q13536 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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