Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms