Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms