Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTDSP1Q9GZU7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms