Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms