Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EME1Q96AY2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EME1Q96AY2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms