Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BRM9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BRM9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BRM9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BRM9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BRM9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3BRM9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3BRM9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H3BRM9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms