Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms