Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms