Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CUX2O14529 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CUX2O14529 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CUX2O14529 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CUX2O14529 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CUX2O14529 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CUX2O14529 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CUX2O14529 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CUX2O14529 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CUX2O14529 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CUX2O14529 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CUX2O14529 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CUX2O14529 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CUX2O14529 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CUX2O14529 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CUX2O14529 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CUX2O14529 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CUX2O14529 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CUX2O14529 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CUX2O14529 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CUX2O14529 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CUX2O14529 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CUX2O14529 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CUX2O14529 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CUX2O14529 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CUX2O14529 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
CUX2O14529 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CUX2O14529 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
CUX2O14529 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CUX2O14529 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CUX2O14529 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CUX2O14529 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CUX2O14529 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CUX2O14529 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CUX2O14529 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CUX2O14529 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CUX2O14529 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CUX2O14529 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CUX2O14529 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CUX2O14529 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CUX2O14529 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CUX2O14529 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CUX2O14529 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CUX2O14529 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CUX2O14529 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CUX2O14529 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CUX2O14529 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CUX2O14529 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CUX2O14529 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CUX2O14529 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CUX2O14529 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUX2O14529 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CUX2O14529 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CUX2O14529 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CUX2O14529 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CUX2O14529 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CUX2O14529 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CUX2O14529 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CUX2O14529 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CUX2O14529 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CUX2O14529 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CUX2O14529 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CUX2O14529 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CUX2O14529 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CUX2O14529 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CUX2O14529 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CUX2O14529 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CUX2O14529 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CUX2O14529 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CUX2O14529 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CUX2O14529 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CUX2O14529 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CUX2O14529 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CUX2O14529 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CUX2O14529 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CUX2O14529 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CUX2O14529 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CUX2O14529 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CUX2O14529 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CUX2O14529 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CUX2O14529 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CUX2O14529 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CUX2O14529 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CUX2O14529 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CUX2O14529 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms