Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN8O00124 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms