Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN6Q9Y6Q1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN6Q9Y6Q1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN6Q9Y6Q1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN6Q9Y6Q1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPN6Q9Y6Q1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAPN6Q9Y6Q1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN6Q9Y6Q1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN6Q9Y6Q1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN6Q9Y6Q1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN6Q9Y6Q1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN6Q9Y6Q1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN6Q9Y6Q1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN6Q9Y6Q1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN6Q9Y6Q1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN6Q9Y6Q1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN6Q9Y6Q1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN6Q9Y6Q1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN6Q9Y6Q1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN6Q9Y6Q1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN6Q9Y6Q1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN6Q9Y6Q1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN6Q9Y6Q1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN6Q9Y6Q1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN6Q9Y6Q1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAPN6Q9Y6Q1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN6Q9Y6Q1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN6Q9Y6Q1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN6Q9Y6Q1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN6Q9Y6Q1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN6Q9Y6Q1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN6Q9Y6Q1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN6Q9Y6Q1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN6Q9Y6Q1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN6Q9Y6Q1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN6Q9Y6Q1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN6Q9Y6Q1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN6Q9Y6Q1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPN6Q9Y6Q1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPN6Q9Y6Q1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPN6Q9Y6Q1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN6Q9Y6Q1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN6Q9Y6Q1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPN6Q9Y6Q1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN6Q9Y6Q1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPN6Q9Y6Q1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN6Q9Y6Q1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN6Q9Y6Q1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN6Q9Y6Q1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPN6Q9Y6Q1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN6Q9Y6Q1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms