Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P8

WIPI2, WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPI2Q9Y4P8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WIPI2Q9Y4P8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
WIPI2Q9Y4P8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WIPI2Q9Y4P8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WIPI2Q9Y4P8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WIPI2Q9Y4P8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WIPI2Q9Y4P8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
WIPI2Q9Y4P8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WIPI2Q9Y4P8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WIPI2Q9Y4P8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WIPI2Q9Y4P8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WIPI2Q9Y4P8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WIPI2Q9Y4P8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WIPI2Q9Y4P8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WIPI2Q9Y4P8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WIPI2Q9Y4P8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WIPI2Q9Y4P8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WIPI2Q9Y4P8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WIPI2Q9Y4P8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WIPI2Q9Y4P8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WIPI2Q9Y4P8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WIPI2Q9Y4P8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WIPI2Q9Y4P8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WIPI2Q9Y4P8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WIPI2Q9Y4P8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WIPI2Q9Y4P8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WIPI2Q9Y4P8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
WIPI2Q9Y4P8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPI2Q9Y4P8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPI2Q9Y4P8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPI2Q9Y4P8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPI2Q9Y4P8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPI2Q9Y4P8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPI2Q9Y4P8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPI2Q9Y4P8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WIPI2Q9Y4P8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WIPI2Q9Y4P8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WIPI2Q9Y4P8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
WIPI2Q9Y4P8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms