Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FARP1Q9Y4F1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FARP1Q9Y4F1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FARP1Q9Y4F1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FARP1Q9Y4F1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FARP1Q9Y4F1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FARP1Q9Y4F1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FARP1Q9Y4F1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FARP1Q9Y4F1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FARP1Q9Y4F1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FARP1Q9Y4F1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FARP1Q9Y4F1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FARP1Q9Y4F1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FARP1Q9Y4F1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FARP1Q9Y4F1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FARP1Q9Y4F1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FARP1Q9Y4F1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FARP1Q9Y4F1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FARP1Q9Y4F1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FARP1Q9Y4F1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FARP1Q9Y4F1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FARP1Q9Y4F1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FARP1Q9Y4F1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FARP1Q9Y4F1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FARP1Q9Y4F1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FARP1Q9Y4F1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FARP1Q9Y4F1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FARP1Q9Y4F1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FARP1Q9Y4F1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FARP1Q9Y4F1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FARP1Q9Y4F1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FARP1Q9Y4F1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FARP1Q9Y4F1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FARP1Q9Y4F1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FARP1Q9Y4F1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FARP1Q9Y4F1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FARP1Q9Y4F1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FARP1Q9Y4F1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FARP1Q9Y4F1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FARP1Q9Y4F1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FARP1Q9Y4F1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FARP1Q9Y4F1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FARP1Q9Y4F1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FARP1Q9Y4F1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FARP1Q9Y4F1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FARP1Q9Y4F1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FARP1Q9Y4F1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FARP1Q9Y4F1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FARP1Q9Y4F1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FARP1Q9Y4F1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FARP1Q9Y4F1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FARP1Q9Y4F1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FARP1Q9Y4F1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms