Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HECTD4Q9Y4D8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HECTD4Q9Y4D8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HECTD4Q9Y4D8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HECTD4Q9Y4D8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HECTD4Q9Y4D8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HECTD4Q9Y4D8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HECTD4Q9Y4D8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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