Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VDAC3Q9Y277 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VDAC3Q9Y277 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VDAC3Q9Y277 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VDAC3Q9Y277 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VDAC3Q9Y277 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VDAC3Q9Y277 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VDAC3Q9Y277 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VDAC3Q9Y277 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VDAC3Q9Y277 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VDAC3Q9Y277 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VDAC3Q9Y277 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VDAC3Q9Y277 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VDAC3Q9Y277 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VDAC3Q9Y277 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VDAC3Q9Y277 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VDAC3Q9Y277 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VDAC3Q9Y277 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VDAC3Q9Y277 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VDAC3Q9Y277 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VDAC3Q9Y277 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VDAC3Q9Y277 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VDAC3Q9Y277 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VDAC3Q9Y277 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VDAC3Q9Y277 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VDAC3Q9Y277 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VDAC3Q9Y277 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VDAC3Q9Y277 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VDAC3Q9Y277 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VDAC3Q9Y277 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VDAC3Q9Y277 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VDAC3Q9Y277 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VDAC3Q9Y277 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VDAC3Q9Y277 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VDAC3Q9Y277 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VDAC3Q9Y277 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VDAC3Q9Y277 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VDAC3Q9Y277 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VDAC3Q9Y277 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms