Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN8AQ9UQD0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN8AQ9UQD0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN8AQ9UQD0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN8AQ9UQD0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN8AQ9UQD0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN8AQ9UQD0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN8AQ9UQD0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN8AQ9UQD0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN8AQ9UQD0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN8AQ9UQD0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN8AQ9UQD0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN8AQ9UQD0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN8AQ9UQD0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN8AQ9UQD0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN8AQ9UQD0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN8AQ9UQD0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN8AQ9UQD0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN8AQ9UQD0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN8AQ9UQD0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN8AQ9UQD0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN8AQ9UQD0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCN8AQ9UQD0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN8AQ9UQD0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN8AQ9UQD0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN8AQ9UQD0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN8AQ9UQD0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN8AQ9UQD0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN8AQ9UQD0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN8AQ9UQD0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN8AQ9UQD0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN8AQ9UQD0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN8AQ9UQD0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN8AQ9UQD0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN8AQ9UQD0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN8AQ9UQD0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN8AQ9UQD0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN8AQ9UQD0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN8AQ9UQD0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN8AQ9UQD0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN8AQ9UQD0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN8AQ9UQD0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN8AQ9UQD0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN8AQ9UQD0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN8AQ9UQD0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms