Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ53

MGAT4B, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4BQ9UQ53 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MGAT4BQ9UQ53 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MGAT4BQ9UQ53 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MGAT4BQ9UQ53 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MGAT4BQ9UQ53 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MGAT4BQ9UQ53 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MGAT4BQ9UQ53 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MGAT4BQ9UQ53 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MGAT4BQ9UQ53 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MGAT4BQ9UQ53 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MGAT4BQ9UQ53 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MGAT4BQ9UQ53 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGAT4BQ9UQ53 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT4BQ9UQ53 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4BQ9UQ53 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4BQ9UQ53 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4BQ9UQ53 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT4BQ9UQ53 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT4BQ9UQ53 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT4BQ9UQ53 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT4BQ9UQ53 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGAT4BQ9UQ53 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGAT4BQ9UQ53 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MGAT4BQ9UQ53 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGAT4BQ9UQ53 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MGAT4BQ9UQ53 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MGAT4BQ9UQ53 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MGAT4BQ9UQ53 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MGAT4BQ9UQ53 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGAT4BQ9UQ53 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MGAT4BQ9UQ53 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms