Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNZ2

NSFL1C, NSFL1 cofactor p47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFL1CQ9UNZ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NSFL1CQ9UNZ2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NSFL1CQ9UNZ2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NSFL1CQ9UNZ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NSFL1CQ9UNZ2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NSFL1CQ9UNZ2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NSFL1CQ9UNZ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NSFL1CQ9UNZ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NSFL1CQ9UNZ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NSFL1CQ9UNZ2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NSFL1CQ9UNZ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NSFL1CQ9UNZ2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NSFL1CQ9UNZ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NSFL1CQ9UNZ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NSFL1CQ9UNZ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NSFL1CQ9UNZ2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NSFL1CQ9UNZ2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NSFL1CQ9UNZ2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NSFL1CQ9UNZ2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NSFL1CQ9UNZ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
NSFL1CQ9UNZ2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NSFL1CQ9UNZ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
NSFL1CQ9UNZ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NSFL1CQ9UNZ2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NSFL1CQ9UNZ2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NSFL1CQ9UNZ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NSFL1CQ9UNZ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NSFL1CQ9UNZ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NSFL1CQ9UNZ2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NSFL1CQ9UNZ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NSFL1CQ9UNZ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NSFL1CQ9UNZ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NSFL1CQ9UNZ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NSFL1CQ9UNZ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NSFL1CQ9UNZ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NSFL1CQ9UNZ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NSFL1CQ9UNZ2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NSFL1CQ9UNZ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NSFL1CQ9UNZ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NSFL1CQ9UNZ2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NSFL1CQ9UNZ2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NSFL1CQ9UNZ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NSFL1CQ9UNZ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NSFL1CQ9UNZ2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NSFL1CQ9UNZ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NSFL1CQ9UNZ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NSFL1CQ9UNZ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NSFL1CQ9UNZ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NSFL1CQ9UNZ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NSFL1CQ9UNZ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NSFL1CQ9UNZ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NSFL1CQ9UNZ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NSFL1CQ9UNZ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NSFL1CQ9UNZ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NSFL1CQ9UNZ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NSFL1CQ9UNZ2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NSFL1CQ9UNZ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms