Protein–RNA interactions for Protein: Q9UND3

NPIPA1, Nuclear pore complex-interacting protein family member A1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA1Q9UND3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPIPA1Q9UND3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPIPA1Q9UND3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPIPA1Q9UND3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPIPA1Q9UND3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPIPA1Q9UND3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPIPA1Q9UND3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPIPA1Q9UND3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NPIPA1Q9UND3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPA1Q9UND3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPA1Q9UND3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPIPA1Q9UND3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPIPA1Q9UND3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPIPA1Q9UND3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPIPA1Q9UND3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPIPA1Q9UND3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPA1Q9UND3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPIPA1Q9UND3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPIPA1Q9UND3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPA1Q9UND3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPA1Q9UND3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPA1Q9UND3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPIPA1Q9UND3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPIPA1Q9UND3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPIPA1Q9UND3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPIPA1Q9UND3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPIPA1Q9UND3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms