Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
L1RE1Q9UN81 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
L1RE1Q9UN81 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
L1RE1Q9UN81 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
L1RE1Q9UN81 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
L1RE1Q9UN81 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
L1RE1Q9UN81 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
L1RE1Q9UN81 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
L1RE1Q9UN81 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
L1RE1Q9UN81 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
L1RE1Q9UN81 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
L1RE1Q9UN81 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
L1RE1Q9UN81 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
L1RE1Q9UN81 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
L1RE1Q9UN81 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
L1RE1Q9UN81 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
L1RE1Q9UN81 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
L1RE1Q9UN81 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
L1RE1Q9UN81 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
L1RE1Q9UN81 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
L1RE1Q9UN81 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
L1RE1Q9UN81 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
L1RE1Q9UN81 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
L1RE1Q9UN81 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
L1RE1Q9UN81 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
L1RE1Q9UN81 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
L1RE1Q9UN81 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
L1RE1Q9UN81 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
L1RE1Q9UN81 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
L1RE1Q9UN81 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
L1RE1Q9UN81 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
L1RE1Q9UN81 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
L1RE1Q9UN81 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
L1RE1Q9UN81 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
L1RE1Q9UN81 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
L1RE1Q9UN81 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
L1RE1Q9UN81 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
L1RE1Q9UN81 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
L1RE1Q9UN81 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
L1RE1Q9UN81 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
L1RE1Q9UN81 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
L1RE1Q9UN81 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
L1RE1Q9UN81 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
L1RE1Q9UN81 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
L1RE1Q9UN81 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
L1RE1Q9UN81 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
L1RE1Q9UN81 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
L1RE1Q9UN81 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
L1RE1Q9UN81 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
L1RE1Q9UN81 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
L1RE1Q9UN81 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
L1RE1Q9UN81 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
L1RE1Q9UN81 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
L1RE1Q9UN81 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
L1RE1Q9UN81 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
L1RE1Q9UN81 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
L1RE1Q9UN81 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
L1RE1Q9UN81 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
L1RE1Q9UN81 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
L1RE1Q9UN81 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
L1RE1Q9UN81 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
L1RE1Q9UN81 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms