Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC4

MCTS1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTS1Q9ULC4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MCTS1Q9ULC4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTS1Q9ULC4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCTS1Q9ULC4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCTS1Q9ULC4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCTS1Q9ULC4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTS1Q9ULC4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTS1Q9ULC4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTS1Q9ULC4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTS1Q9ULC4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTS1Q9ULC4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTS1Q9ULC4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCTS1Q9ULC4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCTS1Q9ULC4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MCTS1Q9ULC4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTS1Q9ULC4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCTS1Q9ULC4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCTS1Q9ULC4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTS1Q9ULC4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTS1Q9ULC4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTS1Q9ULC4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTS1Q9ULC4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTS1Q9ULC4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTS1Q9ULC4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTS1Q9ULC4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTS1Q9ULC4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTS1Q9ULC4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTS1Q9ULC4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTS1Q9ULC4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms