Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKF7

PITPNC1, Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNC1Q9UKF7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNC1Q9UKF7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNC1Q9UKF7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNC1Q9UKF7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNC1Q9UKF7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNC1Q9UKF7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNC1Q9UKF7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITPNC1Q9UKF7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITPNC1Q9UKF7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITPNC1Q9UKF7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PITPNC1Q9UKF7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PITPNC1Q9UKF7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITPNC1Q9UKF7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNC1Q9UKF7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITPNC1Q9UKF7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNC1Q9UKF7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNC1Q9UKF7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNC1Q9UKF7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITPNC1Q9UKF7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNC1Q9UKF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNC1Q9UKF7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNC1Q9UKF7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNC1Q9UKF7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITPNC1Q9UKF7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITPNC1Q9UKF7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNC1Q9UKF7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNC1Q9UKF7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNC1Q9UKF7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNC1Q9UKF7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITPNC1Q9UKF7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITPNC1Q9UKF7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITPNC1Q9UKF7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms