Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDH22Q9UJ99 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDH22Q9UJ99 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDH22Q9UJ99 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDH22Q9UJ99 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDH22Q9UJ99 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDH22Q9UJ99 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDH22Q9UJ99 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDH22Q9UJ99 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDH22Q9UJ99 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDH22Q9UJ99 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDH22Q9UJ99 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDH22Q9UJ99 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDH22Q9UJ99 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDH22Q9UJ99 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDH22Q9UJ99 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDH22Q9UJ99 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDH22Q9UJ99 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDH22Q9UJ99 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDH22Q9UJ99 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDH22Q9UJ99 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDH22Q9UJ99 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CDH22Q9UJ99 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDH22Q9UJ99 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDH22Q9UJ99 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDH22Q9UJ99 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDH22Q9UJ99 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDH22Q9UJ99 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDH22Q9UJ99 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDH22Q9UJ99 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDH22Q9UJ99 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDH22Q9UJ99 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDH22Q9UJ99 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH22Q9UJ99 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH22Q9UJ99 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH22Q9UJ99 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH22Q9UJ99 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDH22Q9UJ99 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDH22Q9UJ99 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDH22Q9UJ99 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDH22Q9UJ99 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDH22Q9UJ99 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDH22Q9UJ99 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDH22Q9UJ99 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDH22Q9UJ99 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDH22Q9UJ99 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CDH22Q9UJ99 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDH22Q9UJ99 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms