Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA9Q9UGM1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA9Q9UGM1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA9Q9UGM1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA9Q9UGM1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA9Q9UGM1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA9Q9UGM1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA9Q9UGM1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA9Q9UGM1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA9Q9UGM1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA9Q9UGM1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA9Q9UGM1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA9Q9UGM1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA9Q9UGM1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA9Q9UGM1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA9Q9UGM1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA9Q9UGM1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA9Q9UGM1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA9Q9UGM1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA9Q9UGM1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA9Q9UGM1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA9Q9UGM1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA9Q9UGM1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA9Q9UGM1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA9Q9UGM1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA9Q9UGM1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA9Q9UGM1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA9Q9UGM1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA9Q9UGM1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA9Q9UGM1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA9Q9UGM1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA9Q9UGM1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA9Q9UGM1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA9Q9UGM1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms