Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLN8Q9UBY8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLN8Q9UBY8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN8Q9UBY8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN8Q9UBY8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLN8Q9UBY8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLN8Q9UBY8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLN8Q9UBY8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLN8Q9UBY8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN8Q9UBY8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN8Q9UBY8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN8Q9UBY8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN8Q9UBY8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN8Q9UBY8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN8Q9UBY8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN8Q9UBY8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN8Q9UBY8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN8Q9UBY8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN8Q9UBY8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN8Q9UBY8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLN8Q9UBY8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLN8Q9UBY8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLN8Q9UBY8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN8Q9UBY8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN8Q9UBY8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN8Q9UBY8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLN8Q9UBY8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN8Q9UBY8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN8Q9UBY8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN8Q9UBY8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN8Q9UBY8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN8Q9UBY8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN8Q9UBY8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN8Q9UBY8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN8Q9UBY8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN8Q9UBY8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN8Q9UBY8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN8Q9UBY8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN8Q9UBY8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN8Q9UBY8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLN8Q9UBY8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms