Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUX4Q9UBX2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX4Q9UBX2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX4Q9UBX2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUX4Q9UBX2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUX4Q9UBX2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUX4Q9UBX2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUX4Q9UBX2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUX4Q9UBX2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUX4Q9UBX2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUX4Q9UBX2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUX4Q9UBX2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUX4Q9UBX2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUX4Q9UBX2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUX4Q9UBX2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUX4Q9UBX2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUX4Q9UBX2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUX4Q9UBX2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUX4Q9UBX2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUX4Q9UBX2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUX4Q9UBX2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUX4Q9UBX2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUX4Q9UBX2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms