Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRPC4Q9UBN4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPC4Q9UBN4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRPC4Q9UBN4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC4Q9UBN4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC4Q9UBN4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC4Q9UBN4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC4Q9UBN4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC4Q9UBN4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC4Q9UBN4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC4Q9UBN4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPC4Q9UBN4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPC4Q9UBN4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC4Q9UBN4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC4Q9UBN4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC4Q9UBN4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC4Q9UBN4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC4Q9UBN4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC4Q9UBN4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC4Q9UBN4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC4Q9UBN4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPC4Q9UBN4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPC4Q9UBN4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPC4Q9UBN4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms