Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCKIPSDQ9NZQ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCKIPSDQ9NZQ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCKIPSDQ9NZQ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCKIPSDQ9NZQ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCKIPSDQ9NZQ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCKIPSDQ9NZQ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCKIPSDQ9NZQ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NCKIPSDQ9NZQ3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCKIPSDQ9NZQ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCKIPSDQ9NZQ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCKIPSDQ9NZQ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NCKIPSDQ9NZQ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCKIPSDQ9NZQ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCKIPSDQ9NZQ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCKIPSDQ9NZQ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCKIPSDQ9NZQ3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NCKIPSDQ9NZQ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NCKIPSDQ9NZQ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCKIPSDQ9NZQ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NCKIPSDQ9NZQ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCKIPSDQ9NZQ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCKIPSDQ9NZQ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCKIPSDQ9NZQ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCKIPSDQ9NZQ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCKIPSDQ9NZQ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCKIPSDQ9NZQ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCKIPSDQ9NZQ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCKIPSDQ9NZQ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCKIPSDQ9NZQ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCKIPSDQ9NZQ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCKIPSDQ9NZQ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCKIPSDQ9NZQ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCKIPSDQ9NZQ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms