Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CNTLNQ9NXG0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CNTLNQ9NXG0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CNTLNQ9NXG0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
CNTLNQ9NXG0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CNTLNQ9NXG0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CNTLNQ9NXG0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CNTLNQ9NXG0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CNTLNQ9NXG0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CNTLNQ9NXG0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CNTLNQ9NXG0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CNTLNQ9NXG0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CNTLNQ9NXG0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CNTLNQ9NXG0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CNTLNQ9NXG0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CNTLNQ9NXG0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CNTLNQ9NXG0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CNTLNQ9NXG0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CNTLNQ9NXG0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CNTLNQ9NXG0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CNTLNQ9NXG0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CNTLNQ9NXG0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
CNTLNQ9NXG0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CNTLNQ9NXG0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CNTLNQ9NXG0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CNTLNQ9NXG0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms