Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS9

PNPO, Pyridoxine-5'-phosphate oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPOQ9NVS9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNPOQ9NVS9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPOQ9NVS9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPOQ9NVS9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPOQ9NVS9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNPOQ9NVS9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNPOQ9NVS9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNPOQ9NVS9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PNPOQ9NVS9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNPOQ9NVS9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNPOQ9NVS9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNPOQ9NVS9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PNPOQ9NVS9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNPOQ9NVS9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNPOQ9NVS9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPOQ9NVS9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPOQ9NVS9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNPOQ9NVS9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNPOQ9NVS9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPOQ9NVS9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNPOQ9NVS9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNPOQ9NVS9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNPOQ9NVS9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNPOQ9NVS9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPOQ9NVS9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNPOQ9NVS9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNPOQ9NVS9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNPOQ9NVS9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PNPOQ9NVS9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNPOQ9NVS9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNPOQ9NVS9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNPOQ9NVS9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNPOQ9NVS9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PNPOQ9NVS9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPOQ9NVS9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms