Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV39

PRR34, Proline-rich protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR34Q9NV39 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRR34Q9NV39 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRR34Q9NV39 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRR34Q9NV39 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRR34Q9NV39 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRR34Q9NV39 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRR34Q9NV39 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRR34Q9NV39 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRR34Q9NV39 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRR34Q9NV39 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRR34Q9NV39 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRR34Q9NV39 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRR34Q9NV39 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRR34Q9NV39 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRR34Q9NV39 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR34Q9NV39 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRR34Q9NV39 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR34Q9NV39 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR34Q9NV39 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRR34Q9NV39 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRR34Q9NV39 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRR34Q9NV39 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRR34Q9NV39 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRR34Q9NV39 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRR34Q9NV39 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRR34Q9NV39 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRR34Q9NV39 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRR34Q9NV39 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms