Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM100Q9NV29 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM100Q9NV29 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM100Q9NV29 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM100Q9NV29 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM100Q9NV29 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM100Q9NV29 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM100Q9NV29 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM100Q9NV29 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM100Q9NV29 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM100Q9NV29 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM100Q9NV29 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM100Q9NV29 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM100Q9NV29 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM100Q9NV29 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM100Q9NV29 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM100Q9NV29 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM100Q9NV29 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM100Q9NV29 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM100Q9NV29 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM100Q9NV29 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM100Q9NV29 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM100Q9NV29 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM100Q9NV29 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM100Q9NV29 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM100Q9NV29 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM100Q9NV29 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM100Q9NV29 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM100Q9NV29 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM100Q9NV29 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM100Q9NV29 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM100Q9NV29 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM100Q9NV29 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM100Q9NV29 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM100Q9NV29 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms