Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SPANXA1Q9NS26 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPANXA1Q9NS26 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SPANXA1Q9NS26 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPANXA1Q9NS26 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SPANXA1Q9NS26 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPANXA1Q9NS26 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPANXA1Q9NS26 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPANXA1Q9NS26 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPANXA1Q9NS26 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPANXA1Q9NS26 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPANXA1Q9NS26 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPANXA1Q9NS26 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPANXA1Q9NS26 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SPANXA1Q9NS26 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SPANXA1Q9NS26 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SPANXA1Q9NS26 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPANXA1Q9NS26 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPANXA1Q9NS26 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPANXA1Q9NS26 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPANXA1Q9NS26 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPANXA1Q9NS26 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPANXA1Q9NS26 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPANXA1Q9NS26 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPANXA1Q9NS26 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPANXA1Q9NS26 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPANXA1Q9NS26 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPANXA1Q9NS26 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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