Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.811e-8■■■■■ 84.4
DROSHAQ9NRR4 MIR503HG-201ENST00000414769 720 ntTSL 224.13■■□□□ 1.451e-8■■■■■ 84.4
DROSHAQ9NRR4 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.051e-8■■■■■ 84.4
DROSHAQ9NRR4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.592e-10■■■■■ 83.1
DROSHAQ9NRR4 GAK-208ENST00000507124 552 ntTSL 436.47■■■■□ 3.431e-13■■■■■ 83
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.957e-11■■■■■ 82.8
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-203ENST00000557930 582 ntTSL 220.79■□□□□ 0.927e-11■■■■■ 82.8
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-205ENST00000560069 575 ntTSL 418.76■□□□□ 0.597e-11■■■■■ 82.8
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.557e-11■■■■■ 82.8
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-204ENST00000559448 2799 ntTSL 214.57□□□□□ -0.087e-11■■■■■ 82.8
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.057e-11■■■■■ 82.8
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.346e-9■■■■■ 82.2
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.596e-9■■■■■ 82.2
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-207ENST00000551594 900 ntTSL 328.69■■■□□ 2.186e-9■■■■■ 82.2
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.96e-9■■■■■ 82.2
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-205ENST00000549039 797 ntTSL 219.07■□□□□ 0.646e-9■■■■■ 82.2
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-206ENST00000550144 544 ntTSL 417.5■□□□□ 0.396e-9■■■■■ 82.2
DROSHAQ9NRR4 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.089e-20■■■■■ 80.7
DROSHAQ9NRR4 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.53e-24■■■■■ 80.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-207ENST00000463309 685 ntTSL 328.75■■■□□ 2.195e-7■■■■■ 80.6
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-208ENST00000464203 766 ntTSL 527.73■■■□□ 2.035e-7■■■■■ 80.6
DROSHAQ9NRR4 FBRSL1-204ENST00000539264 409 ntTSL 236.74■■■■□ 3.472e-7■■■■■ 80.4
DROSHAQ9NRR4 FBRSL1-207ENST00000543360 238 ntTSL 236.27■■■■□ 3.42e-7■■■■■ 80.4
DROSHAQ9NRR4 PTPRF-211ENST00000467464 571 ntTSL 318.66■□□□□ 0.585e-9■■■■■ 79.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 328.32■■■□□ 2.126e-7■■■■■ 79.2
DROSHAQ9NRR4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.173e-10■■■■■ 79.1
DROSHAQ9NRR4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.133e-10■■■■■ 79.1
DROSHAQ9NRR4 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 240.1■■■■■ 4.013e-10■■■■■ 79.1
DROSHAQ9NRR4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.933e-10■■■■■ 79.1
DROSHAQ9NRR4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.723e-10■■■■■ 79.1
DROSHAQ9NRR4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.653e-10■■■■■ 79.1
DROSHAQ9NRR4 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.077e-7■■■■■ 78.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.157e-7■■■■■ 78.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 78.3
DROSHAQ9NRR4 SQSTM1-210ENST00000506042 921 ntTSL 233.01■■■□□ 2.882e-10■■■■■ 78
DROSHAQ9NRR4 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 533.57■■■□□ 2.964e-7■■■■■ 77.9
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DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-211ENST00000602305 961 ntTSL 535.25■■■■□ 3.232e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-214ENST00000602686 977 ntTSL 534.38■■■■□ 3.092e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-212ENST00000602375 1064 ntTSL 534.36■■■■□ 3.092e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-207ENST00000582183 551 ntTSL 432.99■■■□□ 2.872e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-202ENST00000415385 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-204ENST00000538465 925 ntTSL 57.97□□□□□ -1.132e-9■■■■■ 77.7
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DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-206ENST00000581941 813 ntTSL 33.63□□□□□ -1.832e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-209ENST00000582897 482 ntTSL 51.29□□□□□ -2.22e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-223ENST00000497822 542 ntTSL 230.2■■■□□ 2.436e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-210ENST00000465270 543 ntTSL 229.96■■■□□ 2.396e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-216ENST00000484428 578 ntTSL 327.1■■□□□ 1.936e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-219ENST00000489877 536 ntTSL 527.1■■□□□ 1.936e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-215ENST00000482932 826 ntTSL 526.09■■□□□ 1.776e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-217ENST00000486517 726 ntTSL 324.9■■□□□ 1.586e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-213ENST00000471156 764 ntTSL 520.26■□□□□ 0.836e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-204ENST00000368243 879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.266e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-214ENST00000476966 2697 ntTSL 216.42■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-201ENST00000310027 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13□□□□□ -0.336e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-202ENST00000357975 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.11□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-224ENST00000497824 725 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.356e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-205ENST00000400991 473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.27□□□□□ -1.576e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 77.4
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DROSHAQ9NRR4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.287e-7■■■■■ 77.3
DROSHAQ9NRR4 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 77
DROSHAQ9NRR4 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.211e-12■■■■■ 76.5
DROSHAQ9NRR4 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 17e-10■■■■■ 76.2
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DROSHAQ9NRR4 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.911e-10■■■■■ 74.8
DROSHAQ9NRR4 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC8□□□□□ -1.138e-35■■■■■ 74.8
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.246e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 432.82■■■□□ 2.846e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 332.82■■■□□ 2.846e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.316e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 526.88■■□□□ 1.896e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 225.93■■□□□ 1.746e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 223.98■■□□□ 1.436e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.946e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 216.79■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.063e-9■■■■■ 74.3
DROSHAQ9NRR4 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 311.61□□□□□ -0.553e-9■■■■■ 74.3
DROSHAQ9NRR4 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 51.26□□□□□ -2.213e-9■■■■■ 74.3
DROSHAQ9NRR4 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 50.83□□□□□ -2.283e-9■■■■■ 74.3
DROSHAQ9NRR4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.264e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.414e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.364e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.354e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-210ENST00000603364 1551 ntTSL 220.93■□□□□ 0.944e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.814e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.84e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.784e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.354e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.214e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.24e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 73.7
DROSHAQ9NRR4 ZDHHC8P1-203ENST00000420968 1736 ntTSL 230.99■■■□□ 2.552e-9■■■■■ 72.5
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