Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP26Q9NRE1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP26Q9NRE1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP26Q9NRE1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP26Q9NRE1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP26Q9NRE1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP26Q9NRE1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP26Q9NRE1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP26Q9NRE1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP26Q9NRE1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP26Q9NRE1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP26Q9NRE1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP26Q9NRE1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP26Q9NRE1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP26Q9NRE1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP26Q9NRE1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP26Q9NRE1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP26Q9NRE1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP26Q9NRE1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP26Q9NRE1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP26Q9NRE1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP26Q9NRE1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP26Q9NRE1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP26Q9NRE1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP26Q9NRE1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP26Q9NRE1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP26Q9NRE1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP26Q9NRE1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP26Q9NRE1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP26Q9NRE1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP26Q9NRE1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP26Q9NRE1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP26Q9NRE1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP26Q9NRE1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP26Q9NRE1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP26Q9NRE1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP26Q9NRE1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP26Q9NRE1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms