Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ARHGEF3Q9NR81 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF3Q9NR81 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF3Q9NR81 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF3Q9NR81 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF3Q9NR81 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF3Q9NR81 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF3Q9NR81 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF3Q9NR81 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF3Q9NR81 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF3Q9NR81 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF3Q9NR81 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF3Q9NR81 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF3Q9NR81 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF3Q9NR81 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF3Q9NR81 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF3Q9NR81 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF3Q9NR81 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF3Q9NR81 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF3Q9NR81 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF3Q9NR81 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF3Q9NR81 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF3Q9NR81 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF3Q9NR81 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF3Q9NR81 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF3Q9NR81 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF3Q9NR81 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF3Q9NR81 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF3Q9NR81 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF3Q9NR81 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF3Q9NR81 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF3Q9NR81 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF3Q9NR81 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF3Q9NR81 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF3Q9NR81 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF3Q9NR81 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF3Q9NR81 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF3Q9NR81 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF3Q9NR81 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF3Q9NR81 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF3Q9NR81 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF3Q9NR81 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF3Q9NR81 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF3Q9NR81 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF3Q9NR81 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF3Q9NR81 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF3Q9NR81 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF3Q9NR81 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF3Q9NR81 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF3Q9NR81 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF3Q9NR81 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF3Q9NR81 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF3Q9NR81 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF3Q9NR81 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms