Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLE4Q9NR33 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLE4Q9NR33 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLE4Q9NR33 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLE4Q9NR33 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLE4Q9NR33 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLE4Q9NR33 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLE4Q9NR33 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLE4Q9NR33 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLE4Q9NR33 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLE4Q9NR33 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLE4Q9NR33 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLE4Q9NR33 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLE4Q9NR33 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLE4Q9NR33 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLE4Q9NR33 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLE4Q9NR33 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLE4Q9NR33 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLE4Q9NR33 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLE4Q9NR33 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLE4Q9NR33 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLE4Q9NR33 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLE4Q9NR33 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLE4Q9NR33 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLE4Q9NR33 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLE4Q9NR33 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLE4Q9NR33 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLE4Q9NR33 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLE4Q9NR33 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLE4Q9NR33 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLE4Q9NR33 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLE4Q9NR33 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLE4Q9NR33 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLE4Q9NR33 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLE4Q9NR33 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLE4Q9NR33 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLE4Q9NR33 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLE4Q9NR33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLE4Q9NR33 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLE4Q9NR33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLE4Q9NR33 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLE4Q9NR33 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLE4Q9NR33 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLE4Q9NR33 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms