Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CD163L1Q9NR16 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CD163L1Q9NR16 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CD163L1Q9NR16 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CD163L1Q9NR16 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CD163L1Q9NR16 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CD163L1Q9NR16 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CD163L1Q9NR16 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CD163L1Q9NR16 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CD163L1Q9NR16 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CD163L1Q9NR16 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CD163L1Q9NR16 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CD163L1Q9NR16 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CD163L1Q9NR16 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CD163L1Q9NR16 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CD163L1Q9NR16 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CD163L1Q9NR16 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CD163L1Q9NR16 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CD163L1Q9NR16 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CD163L1Q9NR16 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CD163L1Q9NR16 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CD163L1Q9NR16 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CD163L1Q9NR16 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CD163L1Q9NR16 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CD163L1Q9NR16 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CD163L1Q9NR16 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CD163L1Q9NR16 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CD163L1Q9NR16 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CD163L1Q9NR16 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CD163L1Q9NR16 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CD163L1Q9NR16 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CD163L1Q9NR16 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CD163L1Q9NR16 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CD163L1Q9NR16 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CD163L1Q9NR16 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CD163L1Q9NR16 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CD163L1Q9NR16 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CD163L1Q9NR16 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CD163L1Q9NR16 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CD163L1Q9NR16 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CD163L1Q9NR16 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CD163L1Q9NR16 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CD163L1Q9NR16 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CD163L1Q9NR16 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CD163L1Q9NR16 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CD163L1Q9NR16 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CD163L1Q9NR16 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CD163L1Q9NR16 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CD163L1Q9NR16 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CD163L1Q9NR16 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CD163L1Q9NR16 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CD163L1Q9NR16 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CD163L1Q9NR16 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CD163L1Q9NR16 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CD163L1Q9NR16 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CD163L1Q9NR16 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CD163L1Q9NR16 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CD163L1Q9NR16 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CD163L1Q9NR16 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CD163L1Q9NR16 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CD163L1Q9NR16 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CD163L1Q9NR16 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CD163L1Q9NR16 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CD163L1Q9NR16 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CD163L1Q9NR16 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CD163L1Q9NR16 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
CD163L1Q9NR16 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CD163L1Q9NR16 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CD163L1Q9NR16 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CD163L1Q9NR16 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CD163L1Q9NR16 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CD163L1Q9NR16 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CD163L1Q9NR16 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CD163L1Q9NR16 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms