Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HINT3Q9NQE9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HINT3Q9NQE9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HINT3Q9NQE9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HINT3Q9NQE9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HINT3Q9NQE9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HINT3Q9NQE9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HINT3Q9NQE9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HINT3Q9NQE9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HINT3Q9NQE9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HINT3Q9NQE9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HINT3Q9NQE9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HINT3Q9NQE9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HINT3Q9NQE9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HINT3Q9NQE9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HINT3Q9NQE9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HINT3Q9NQE9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HINT3Q9NQE9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HINT3Q9NQE9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HINT3Q9NQE9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HINT3Q9NQE9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HINT3Q9NQE9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HINT3Q9NQE9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HINT3Q9NQE9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HINT3Q9NQE9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HINT3Q9NQE9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HINT3Q9NQE9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HINT3Q9NQE9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HINT3Q9NQE9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms