Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IL1RAPQ9NPH3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL1RAPQ9NPH3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL1RAPQ9NPH3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL1RAPQ9NPH3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL1RAPQ9NPH3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IL1RAPQ9NPH3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IL1RAPQ9NPH3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL1RAPQ9NPH3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IL1RAPQ9NPH3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IL1RAPQ9NPH3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL1RAPQ9NPH3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL1RAPQ9NPH3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL1RAPQ9NPH3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL1RAPQ9NPH3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL1RAPQ9NPH3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IL1RAPQ9NPH3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IL1RAPQ9NPH3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IL1RAPQ9NPH3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IL1RAPQ9NPH3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IL1RAPQ9NPH3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IL1RAPQ9NPH3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IL1RAPQ9NPH3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IL1RAPQ9NPH3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IL1RAPQ9NPH3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IL1RAPQ9NPH3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IL1RAPQ9NPH3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IL1RAPQ9NPH3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IL1RAPQ9NPH3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IL1RAPQ9NPH3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IL1RAPQ9NPH3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IL1RAPQ9NPH3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IL1RAPQ9NPH3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IL1RAPQ9NPH3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IL1RAPQ9NPH3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IL1RAPQ9NPH3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IL1RAPQ9NPH3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IL1RAPQ9NPH3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IL1RAPQ9NPH3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IL1RAPQ9NPH3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IL1RAPQ9NPH3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IL1RAPQ9NPH3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IL1RAPQ9NPH3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IL1RAPQ9NPH3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IL1RAPQ9NPH3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IL1RAPQ9NPH3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms