Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NGRNQ9NPE2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NGRNQ9NPE2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NGRNQ9NPE2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NGRNQ9NPE2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NGRNQ9NPE2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NGRNQ9NPE2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NGRNQ9NPE2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NGRNQ9NPE2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NGRNQ9NPE2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NGRNQ9NPE2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NGRNQ9NPE2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NGRNQ9NPE2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NGRNQ9NPE2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NGRNQ9NPE2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NGRNQ9NPE2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NGRNQ9NPE2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NGRNQ9NPE2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NGRNQ9NPE2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NGRNQ9NPE2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NGRNQ9NPE2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NGRNQ9NPE2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NGRNQ9NPE2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NGRNQ9NPE2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NGRNQ9NPE2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NGRNQ9NPE2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NGRNQ9NPE2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NGRNQ9NPE2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGRNQ9NPE2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGRNQ9NPE2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGRNQ9NPE2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGRNQ9NPE2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGRNQ9NPE2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NGRNQ9NPE2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NGRNQ9NPE2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NGRNQ9NPE2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NGRNQ9NPE2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NGRNQ9NPE2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NGRNQ9NPE2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NGRNQ9NPE2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NGRNQ9NPE2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NGRNQ9NPE2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NGRNQ9NPE2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NGRNQ9NPE2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NGRNQ9NPE2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NGRNQ9NPE2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NGRNQ9NPE2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NGRNQ9NPE2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NGRNQ9NPE2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NGRNQ9NPE2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NGRNQ9NPE2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NGRNQ9NPE2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NGRNQ9NPE2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NGRNQ9NPE2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NGRNQ9NPE2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NGRNQ9NPE2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NGRNQ9NPE2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NGRNQ9NPE2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NGRNQ9NPE2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NGRNQ9NPE2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NGRNQ9NPE2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NGRNQ9NPE2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NGRNQ9NPE2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NGRNQ9NPE2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NGRNQ9NPE2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NGRNQ9NPE2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NGRNQ9NPE2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NGRNQ9NPE2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NGRNQ9NPE2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NGRNQ9NPE2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NGRNQ9NPE2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NGRNQ9NPE2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NGRNQ9NPE2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms